在新形势下，如何加强和改进高校党的领导方式，更有效地发挥基层党组织的作用？近年来，南京大学党委通过5种模式开展党组织共建活动，整合和优化资源，走出了一条富有特色的党建工作新路子。
多年来，高校党建工作形成了“学校党委—院系一级党委（总支）—党支部—党小组—党员”的纵向组织管理模式。这种模式组织严密、纪律性强，但党内生活缺乏互动。近年来南京大学党委，在巩固业已建成的纵向组织管理模式的基础上，积极加强党组织之间、党员之间的横向联系，创建了党组织工作的5种模式：
传统优势学科强强联合，推进学科群建设。物理学系党委和化学化工学院党委经过双方一年多的努力，共建已初见成效，两院系领导和教师之间的沟通加强，教师之间已开展科研合作，并联合申请科研项目。
新兴学科相互支撑、推动跨越式发展。电子科学与工程系党委和工程管理学院党总支以发展“小而精”的工程应用学科为目标，以本科教学为切入点，在人才培养、科学研究、社会服务、行政管理、党建和思想政治工作等领域全面展开合作，并向学科建设、队伍建设、对外交流的层次拓展。
相同专业跨学校共建、促进人才培养。5年来，大气科学系研究生支部和解放军理工大学气象学院某支部从培养素质高、能力强、全面过硬的跨世纪人才的共同育人目标入手，积极开展思想政治与学术文化方面的共建活动。
畅通机关与院系的联系渠道、加强机关作风建设。研究生院党支部与化学化工学院博士生党支部在共建中，创立了“博士论坛”、召开了“创新素质培育座谈会”、“博士论文讨论会”等交流会，学校机关与学生之间加强了沟通和了解，为机关作风的改进找到了一面“镜子”。
院系、机关、企业多方面共建，凸显高校的社会功能。就业中心———心理中心党支部、物理系鼓楼校区学生党支部和南京福中信息产业集团公司党支部之间的共建，是这方面的代表。
南京大学的共建活动，让党员亮明了身份，明确了党员应该承担的职责与义务，有效增强了党员的荣誉感和责任感。
